器乐系主要培养具有国际水平的演奏能力、敏感的音乐感性和优秀的表达能力以及丰富的音乐知识和解析能力的创意性专业演奏者。器乐系下设包括键盘乐器、弦乐器、管乐器、打击乐器的21个专业，本院的教育课程最有效地反映了上面提出的教育目标，也最大程度地反映了各种乐器的特性。
教育课程大致可分为三类。第一，提高专业乐器演奏能力的科目。包括专业实践技能、各个专业的工作坊、室内乐、各种合奏等课程，大部分课程属于专业必修课程。第二，与作为音乐家必须具备的基本素养、专业音乐知识的积累、音乐作品解析能力的深化相关的科目。包括视唱听音、西方音乐文法、西方音乐史、键盘和声、专业类别文献、总谱解读、通奏低音等科目。第三，通过对音乐整体、其他艺术体裁、以及人文学的体验和研究，让学生构建宽广、创造性的艺术世界。与之相关的科目有音乐史、辅修专业实践技能、合唱、艺术史、外语、文化的理解、各种主题特别讲座等。通过舞台上的实际演奏，让学生把教育课程中所学的演奏能力、情感调节能力、解析能力充分地表现出来。还为学生提供独奏、室内乐、各种合奏等多种形式的演奏机会。